کمیسیون انجمنهای علمی وزارت علوم، تحقیقات و فناوری عملکرد انجمنها را در سال ۱۳۹۸ ارزیابی کرد که انجمن علمی باستانشناسی ایران در رتبۀ «ب» قرار گرفت.